對垂直流凈化工作臺而言，zui主要的就是空氣循環過濾的過程，這就是一切垂直流凈化工作臺為達到凈化目的采取的基本手段，在這個過程中，風機起到了心臟的作用：它泵浦箱體內的空氣，使它不段的循環，更新；箱體就象人的身體，它的氣密性使外界渾濁的空氣無法侵入，并且為空氣循環提供了風道；空氣過濾器捕捉空氣中塵埃，使通過它的空氣凈化。這里，需要注意的是垂直流凈化工作臺里不是處處是凈化的，過濾器和空氣循環模式只能保證空氣離開過濾器出風口后在部分空間內是純凈的，一般這個空間被稱為工作區域，只有在這個區域操作，才是安全的。而zui臟的，不用說，就是過濾器本身了。

    開環空氣循環模式主要特征是在每次循環中所有空氣從外界采入并zui終都回到環境中去，一般水平流的垂直流凈化工作臺都采用開環模式。這種模式的垂直流凈化工作臺結構較簡單，成本低廉，但是風機和過濾器的負載較大，對其壽命會產生不良影響。同時*開環的空氣循環的凈化效率不高，且外排的空氣可能會攜帶部分樣本中的細菌等，可能會對環境造成危害。通常只用于凈化要求較低的或是無生物危害的場合。可見，閉環模式其實也不是*封閉的氣流循環，每次循環中將有的空氣排放到環境空間，但這些外排的氣體已經過一個外排空氣過濾器的過濾的氣體流過工作區域后經導流孔重新進入下一個循環過程，較外界吸入的空氣而言，這些氣體還是比較純凈的，這樣過濾器的負載就較小，壽命也會較長。這種空氣循環模式為目前主流產品所采用。